Используйте контейнер MP4, кодек H.264, но для сжатия не указывайте битрейт, а пользуйтесь CRF. Чего-то в районе 25-30 должно хватить. Чем больше число, тем хуже качество, но меньше размер.
This command encodes a video with good quality, using slower preset to achieve better compression:
ffmpeg -i input.avi -c:v libx264 -preset slow -crf 22 -c:a copy output.mkv
https://trac.ffmpeg.org/wiki/Encode/H.264
Это можно сделать либо через ffmpeg, либо через любой его GUI, например
Handbrake.
Дополнительно файл можно сжать сильнее, если уменьшить его FPS. Поскольку это слайдшоу, 1 FPS должно хватить за глаза, если изображения статичны.
С готовым видео после ffmpeg-а это можно сделать, например, с помощью
mp4box:
mp4box -add input.mp4:fps=1 -new output.mp4
Лекция у вас в каком виде? Уже готовый видеофайл?