Константин

Да любая crm должна справится с такой задачей.
Описанное вами базовая функциональность.

Может стоит найти бизнес-коесультанта-аналитика. Он посмотрит и предложит готовое решение.
И с экономите время и деньги на разработке

zoho
onlyoffice

В компании со сложными бизнес-процессами пришли к внедрению CRM.

Моделирование!!!!
Нужно потратить время:
1. Описание процессов
2. Выбор под описание 2-3 штуки. crm-ки, путем пробы Lightly-версии процессов
3. Hard-версия пробы внесения процессо в выбранную систему

(например Amo или Б24)

едины, вот Хабре есть один представитель crm, даже вообщем и ничего так)

- генерировать штрих-код в карточке товара (для тех у кого их нет) чтоб потом можно было напечатать и поклеить штрих-коды на свою продукцию. Либо для быстрого поиска товара, в списке, просто "пикнул" и нашел его среди нескольких тысяч других товаров.

Учитывайте упаковки если они имеются у товара, каждая должна иметь свой ШК.
Таже возможность задать несколько ШК на один Товар. Было такое когда "Сок добрый" приходил с разных заводов с разными ШК, а так товар идентичный.

- генерировать штрих-код для счетов/накладных. Потом можно отсканировать и также найти нужную накладную среди всех накладных.

Тут проще привязаться каком внутреннему Гиуду и его выводить на ШК какой-нибуть ean 128

- программа лояльности.

оба варианта хороши. Тут лучше получить описание самой программы, какую хотят. А дальше решать что будет реализовывать. Программ куча разных.
А также зависит для какой отрасли пишете, у каждая имеет свою малюсеньку но особенность)

Прочитав вопрос, возникли сомнения в некоторой ИТ компетенции. В частности умения пользоваться поисковиками....
С описанным послужным списком, должны были просмотреть и опробовать кучу разных CRM, высказав что в них не нравится. Ну ходяб определится с параметрами что нужно от системы с которых не хватает.

ps:
Начните работать в любой. Почитайте литературку в частности... Итого поймете что вам ближе к душе)

Сrm для складского и управленческого учета?

в понятиях определитесь)))

бери за пример/идею на PornoHab, такое точно оценят)))

книга от 1С в принципе познавательно)

свободная коробочная

словосочетание не сочитаемое

Денег много?

Возможно есть какие то "полуфабрикаты" ?

1С - эта платформа как раз заточенная для реализации таких задач)))
из плюсов дешево, наличие спецов, из минусов найти толково постановщика. Хотя это общий минус)

а так систем хватает, хотябы - Odoo .

из 1с
смотрите конфигурации Розница, УНФ. Они проще в настройке и старте. Функционала для начала выше крыши, Розница чистый магазин, из такого можно выделить наличие использования скидочных карт возможность настройки их использования. УНФ целостная управленческая система, производсвто, ЗП, УУ доходы расходы, что надо понимания общей картины деятельности.
УТ функционал по больше, он больше ориентирован для оптовой торговли. Сложней в самостоятельном изучении, ранее перечисленные намного прощее и в наличии литература хорошая по работе.
v8.1c.ru/retail
v8.1c.ru/small.biz
opencart - тут придется доделывать, хотя есть готорые решения которые их надо смотреть.

ту в которой будет работать, а не хвастаться что купили.

v8.1c.ru/small.biz/usef/mobile.htm

Можно по вас чтонибуть простенькое написать на 1с для работы с телефона и не только.

https://habr.com/post/340348/

Можно от толкнуться от учетной системы. Для не которых есть готовые решения, которые можно подправит по "уникальные желания"

мда, а глянуть возможности битрикса не пробовали?
https://www.bitrix24.ru/features/call.php

заказов

добавить на документ Статусы. На каждой статус свой вариант движения по регистрам. Отборов и доступов в журналах для разных ролей пользователей.
Разные реквизиты кто принял, кто выполнил, когда, что использовал. Заполнение реквизитов сделать обязательным в зависимоти от Статуса документа.