Zettabyte

В первую очередь сделайте копию всех важных данных на сервере и убедитесь, что в копии они не повреждены.

развернут ESXI 6.5 ... Диски работают в RAID 1+0 под контроллером HP b120i

ESXI и RAID-контроллер - это действительно, два "слоя", которые могут помешать взаимодействию с дисками напрямую. Как минимум, с рэйд-контроллером надо изучать как работает он сам, что позволяют его драйверы, и какой софт доступен.

Если не получится пробиться в родной ОС, то пронумеруйте диски, разберите массив, и подключите диски напрямую к компьютеру с Виндоус. Windows давно стала отраслевым стандартом в data recovery и весь самый интересный софт разрабатывается под неё, независимо от того, с какими накопителями ведётся работа. Если она предложит инициализировать/форматировать диски, или запустит проверку - откажитесь / остановите.

Скачайте и распакуйте R.tester: https://rlab.ru/tools/rtester.html
В нём можно как посмотреть SMART, так и сделать максимально детальные тесты чтения, которые покажут состояние поверхности.
Можно также сделать тесты записи, но они уничтожают всё безвозвратно, так что предварительно надо готовиться (бэкапить данные или делать образы дисков).

SSD отображается в Defragger как HDD

Windows определяет тип накопителя на основе результатов тестирования. Соответственно, вам поможет WinSAT.exe, она же Windows System Assessment Tool.

Для начала проверьте не работают ли у вас какие-то утилиты, которые либо на лету, либо постоянно что-то "оптимизируют". Если они есть, то отключите, либо удалите их.

Синтаксис WinSAT описан достаточно лаконично, так что может потребоваться несколько попыток. Запустите cmd от администратора и начните с команды winsat disk -drive d. Если после неё ситуация не изменится, таким же образом запустите winsat diskformal. Если и это не поможет, сделайте полную переоценку: winsat formal

Также на всякий случай хорошо бы убедиться, что у вас нет ухищрений с кэшированием от производителя ноутбука наподобие установки маленького ССД на 32 ГБ, а также, что в BIOS настройки выставлены корректно.

В случае сомнений относительно оценки Виндоус, можете сделать тест скорости SSD самостоятельно, например, в Р.тестере.

Если и после этого Defraggler будет определять диск некорректно, то скорее всего, его надо сносить - это уже, видимо, баг программы, который должен исправляться разработчиками.

задана задача на автоматическую дефрагментацию (отключить я её не могу т.к. дефрагер не позволяет залезть в соответствующую менюшку, интегрируясь в систему)

В "Optimize Drives" есть секция "Scheduled optimization", там указана Frequency и есть кнопка "Change settings". Как оно у вас - угадать не могу, т.к. Дефрагглер у меня не установлен.

Начните с того, что выньте ЖД из ноутбука и подключите его напрямую к стационарному компьютеру с Windows. Проверьте виден ли он в БИОС там. Если в BIOS диск присутствует, то скачайте R.tester и посмотрите SMART, также можете сделать автоматическую диагностику.

Если при включении ноутбука жёсткий диск издаёт какие-либо нестандартные звуки - щелчки, скрежет, писк, и подобные, то останавливайтесь, самостоятельно ничего не сделать, даже простая попытка включения может добить жёсткий диск до состояния, когда ничего нельзя будет сделать.
Никакими программами пользоваться нельзя.

Если другого компьютера нет, либо винчестер при подключении не виден, либо издаёт посторонние шумы, и на нём есть важная информация, то выбирайте компанию, занимающуюся восстановлением данных, и идите на диагностику к ним. Адекватные делают диагностику при владельце и бесплатно. Как минимум, это поможет полноценно разобраться в ситуации, как максимум - спасти ваши файлы.

В чëм особенность режима PIO

У нас есть специализированные инструменты, так что Victoria мы не пользуемся, но из разговоров с Сергеем Казанским помню, что он позиционировал режим PIO как вариант для экспериментов и ограниченных по возможностям попыток ремонта. Этот режим - попытка избежать вмешательства драйверов Windows в вашу работу с диском, т.к. в случае экспериментов они могут оказать ненужное влияние, а в случае работы с полуживыми накопителями, Windows API их просто добьёт.

обнаружить совсем мëртвый диск, который даже BIOS не видит?

Я могу неточно помнить подробности, но во времена, когда мы обо всём этом говорили, нужно было предварительно в БИОСе переключать режим доступа к диску с ACHI на Legacy. А вы этого сделать не сможете.
Кстати, в те времена точно не было, как минимум, Windows 10. Если у вас она, то неясно получится ли завести PIO вообще.

Да и в целом я полагаю, что в вашем случае вряд ли поможет какой-либо "пользовательский" софт вообще.
Но на всякий случай, можете дополнительно попробовать R.tester: https://rlab.ru/tools/rtester.html
Это схожая программа для проверки дисков, но написанная до определённой степени по-другому, и с учётом того, что на наш взгляд, стоило улучшить в других утилитах.
Тоже бесплатная и работает без установки.

P.S.
Кстати, если вы пытаетесь что-то сделать с жёстким диском, т.к. хотите восстановить данные, то лучше заканчивайте и даже не включайте его. Текущая ситуация неясна, а добить накопитель можно всегда. В этом случае лучше найдите специалиста в своём регионе и сходите к нему на диагностику. У адекватных она бесплатная.

показатель SMART - сектора, которые не удалось переназначить

Уточните, пожалуйста, название атрибута на английском, либо его ID (Number).
Вы имеете в виду атрибут 198 (С6) Offline Uncorrectable Sector Count (Uncorrectable Sector Count)?
В нём содержится количество секторов-кандидатов на переназначение, обнаруженных при оффлайн-тестировании, которое диск запускает во время простоя в соответствии с параметрами, зависящими от прошивки.

сектора - кандидаты на переназначение?

197 (С5) Current Pending Sector Count - речь про него?
Это и есть количество секторов-кандидатов на переназначение в резервную область.
Т.е. количестве секторов, которые диск встретил в процессе работы, и которые ему «не понравились». Сначала этот сектор помечается как кандидат на переназначение и заносится в соответствующий внутренний список (в этот момент параметр 197 / C5 увеличивается).

Впоследствии этот сектор может быть как выведен из списка (с уменьшением параметра), так и переназначен, при это атрибут 197 также уменьшится, но увеличатся атрибуты 196 (С4) Reallocated Event Count и 05 Reallocated Sector Count, также будут сделаны соответствующие пометки в G-list.

- P.S. -
Если у вас в программе всё на русском, можете посмотреть оригинальные названия параметров СМАРТ в R.tester'е.
В нём также есть функция автоматической диагностики, интерпретирующая параметры и выводящая возможные варианты проблем с жёстким диском.

P.P.S
В любом случае, если сомневаетесь в здоровье HDD, начинайте с копирования важных данных на другой накопитель, это важнее любых проверок жёсткого диска. Потом может быть поздно.
Также ни в коем случае не пытайтесь "лечить" диск поделиями наподобие HDD Regenerator.

начала запустилась но очень сильно тупила и прочее ... После перезагрузки при загрузке винды просто чёрный экран появляется с мышкой и висит

Состояние диска ухудшается, лучше всего прекратите все попытки каких-либо обращений к диску или его включения.

забрать важные файлы ... как мне сохранить файлы с этого харда?

Если данные на харде нужно спасти, то сейчас лучший вариант - это обратиться в специализированную компанию, занимающуюся восстановлением важных файлов. По ссылке - универсальная памятка о выборе специалиста по восстановлению данных.
Судя по описанию, самостоятельные попытки вряд ли приведут к чему-то помимо ухудшения состояния диска, а в нормальных местах диагностика бесплатная. Вы можете обратиться хотя бы за ней, чтобы лучше понимать что произошло с жёстким диском.

Если данные на диске не важны, или вы готовы рисковать (невозможностью восстановления, либо высокой ценой), то можете попробовать продиагностировать хард R.tester'ом (но лучше не стоит). В нём можно как посмотреть тот же SMART, так и сделать автоматическую диагностику.

Повторюсь, что идеальный вариант - это самостоятельно HDD даже не включать, и единственно-безальтернативный, если вы вдруг слышали нестандартные звуки при старте диска (они могут быть тихими, надо прислушиваться). В случае посторонних шумов вы гарантированно убиваете диск всё время, пока он крутится.

заявлена возможность подключения до 122 дисков. Как это реализовать

Выделите полчаса на то, чтобы погуглить различные словосочетания, включающие в себя слова "expander" и "backplane".
Это то, что вам нужно как в плане железа, так и в плане знаний. Если вы раньше никогда не работали с подобным оборудованием, то хотя бы базово однозначно стоит разобраться, иначе потом могут быть неприятные сюрпризы.

Докупать нужные железки надо б/у на eBay, авито, хламаде, и т.п.

старому SAS-контроллеру

Обязательно обратите внимание на вот эту статью KB, т.к. к вашей плате она тоже относится: https://www.broadcom.com/support/knowledgebase/121...

If a drive larger than two TeraBytes in capacity is used with an LSI 3Gb/s SATA+SAS HBA, you will not be able to use the remaining capacity beyond 2TB.

Я бы не особо полагался на выделенную жирным часть цитаты, а по умолчанию полагал, что диски больше 2 ТБ использовать нельзя. Если всё же хотите рискнуть, то необходимо предварительно провести тщательную проверку поведения с большими дисками.
В противном случае однозначно станете нашим клиентом, а с учётом того, для каких RAID'ов обычно используют такие железки, и какие повреждения ожидаемы, ещё и с непредсказуемым исходом.

Также обратите внимание, что по-моему, у вас RAID-контроллер, их работа обычно отличается от HBA-адаптеров.

Купил винт на 6 Тб (WD Blue) и записал много файлов, около 500к

Главный вопрос сейчас в том, насколько важны для вас эти файлы и есть ли у вас их копия.

потом пошел треск с винта с периодичностью в 0.5 секунды

По описанию сложновато представить однозначно, вот примеры издаваемых HDD звуков. Что-нибудь похоже на то, как трещит ваш жёсткий диск?

Это заводской брак, или неправильное использование винта?

Дальше нужно понимать что важнее - сохранить информацию на диске, или разобраться в проблеме?
Если данные критически важны, то лучше вообще остановиться и не мучать диск ничем и никак.
Если есть копия или возможность рискнуть, то начните с просмотра SMART, это можно сделать в Р.тестере: https://rlab.ru/tools/rtester.html

Эта же программа покажет использует ли ваш диск SMR или нет.
Затем, если будет видно, что диск не при смерти, можно подумать над тем, чтобы сделать тест чтения.

Но по-хорошему, если будет видно, что диск скорее исправен, чем нет, начать лучше с копирования самых важных данных на другой носитель.

При этому система работает нормально

Сначала скопируйте все важные данные с диска и убедитесь, что копии рабочие. Без этого ничего не делайте.

Кроме того, как я понимаю, вы уже держали компьютер во включенном состоянии некоторое время и ничего не поменялось? У некоторых ошибка уходит после ожидания - у кого-то через 30-40 минут, у кого-то - через 2-3 часа.

Кто-то предлагает в таких случаях запускать First Aid, но я не очень доверяю такому совету в плане сохранности данных, да и у вас эта кнопка отключена.

Запустите терминал (Finder -> Applications -> Utilities -> Terminal), напишите там diskutil list. Посмотрите что выдаст команда. На основе результата можете попробовать смонтировать либо диск со скриншота, либо нужный, если у него другой идентификатор (укажите его вместо disk1s1): diskutil mount /dev/disk1s1.

Откройте Activity Monitor и поищите там процесс fsck_файловаясистема, т.е. начните писать в поиске fsck, и смотрите на появление в результатах fsck_hfs или подобного.
Щёлкните на крестик и сделайте ему Force Quit.

Дальше ещё можно самостоятельно запускать принудительную fsck в разных режимах, но это тоже может покрошить данные, так что лучше пока ограничиться вышеизложенным.

утилиты для переформатирования винчестера ... norton utilities, calibrate. Отличная штука

У меня маловато опыта с жёсткими дисками того времени, но полагаю, что и в целом людей, у которых его в достатке, на просторах бывшего СССР немного. Склонен так думать из-за того, что в те времена зарубежные персональные компьютеры были слишком большим раритетом. А когда они начали у нас появляться более массово, технологии уже успели продвинуться вперёд, отправив в историю целый ряд производителей жёстких дисков, названия которых многие даже не слышали.

Насколько мне известно, Калибрейт из пакета "Нортон утилиты" была настолько популярной во многом из-за того, что с её помощью можно было подобрать оптимальное значение interleave для жёсткого диска. Это явно стоило делать для RLL и MFM-винчестеров с ёмкостью в мегабайтах - скорость передачи данных вполне можно было повысить в три раза.

Точно оценить сложно, но я думаю, что, несмотря на её возможности, утилита Calibrate утратила актуальность примерно к середине 90-х. "Средний" винчестер тех времён заметно подрос и уже не требовал к себе такого внимания со стороны пользователя. Собственно, поэтому в Norton Utilities, предназначенных для Windows, вы вряд ли найдёте тот самый calibrat.exe.

Даже не самые новые диски сильно отличаются от дисков тех времён.
В самых же современных вовсю творится адъ и израиль - 4-хядерный процессор на плате стал нормой, появляются элементы наподобие транслятора.
Из-за разницы в размерах головок чтения и записи внедряются новые технологии записи, например, SMR. С результатом можно наглядно ознакомиться тут: https://habr.com/ru/post/529860/

Если же отвечать кратко, то не совсем ясно, что вы имеете в виду, говоря "переформатирование".
Жёсткий диск у вас отформатирован как-то не так? Как именно? И во что вы хотите его переформатировать?

Было бы хорошо, если бы вы указали точную модель диска, а также какую задачу вы хотите решить.
Если она связана с потерей и восстановлением данных, то никакое форматирование (и смежные с ним операции) не помогут, скорее сделают хуже.
Если вам нужно как-то проверить жёсткий диск, возьмите Р.тестер, в нём есть возможность максимально детализировать результаты тестов, сделать детализацию выше, на наш взгляд, невозможно.