Надо было делать дамп средствами Джанго, а не MySQL. Для этого есть команда manage.py dumpdata которая делает дамп в форматах JSON/YAML/XML. Можно сделать дамп конкретного приложения и потом использовать его как начальные данные. Этот механизм называется фикстуры.
Почитайте. А вот как SQL перекинуть в JSON, YAML или XML... Там надо не просто перекинуть, а с определенной структурой чтобы Джанго это подхватил. Первая мысль (скорее всего неудачная) - создать временную базу и закинуть туда данные из SQL-дампа. Потом написать скриптик на питоне, который создаст файл в JSON/YAML/XML формате с правильной структурой беря данные из временной базы. Затем просто загрузить его с помощью manage.py loaddata. Вот такой ужас :)). Наверняка есть варианты попроще, но мне копать лень.
