limb

Вылетает только на 0 сцене из-за того что скрипт инициализируется только на этой сцене. Попробуйте добавить объект на котором висит скрипт в DontDestroyOnLoad. Почему создаёт две кнопки, не знаю, скрипт слегка непонятный. Да и к тому же в чём проблема вручную расставить кнопки по уровням. У вас их там 1000 чтоли?
canvasLevel вы закидываете через инспектор?

Это 3д или 2д проект? На объекте есть какой - нибудь скрипт?

Возможно это костыль, но можно добавить DontDestroyOnLoad в if, который будет зависеть от bool переменной. Когда экземпляр DontDestroyonLoad создан, просто изменять bool переменную на false и сохранять в PlayerPrefs. А при выходе из игры опять изменять значение переменной на true и сохранять, чтобы в следующем запуске меню появилось. (playerPrefs не принимает bool, поэтому можно использовать 0 и 1).