АртемЪ

Обычное железо, не вижу ничего серверного.
Если исправное - будет работать.
Для озвученных целей вполне пойдет.

А как в случае P2P? злоумышленнику необходимо всегда поддерживать соединение с несколькими узлами?

Не обязательно.

А если эти узла прекратят свою активность, контроль над ботом пропадет?

Да.

Возможно ли настроить PAC скрипт на Mikrotik?

На роутере скрипты настраивать неудобно, лучше с компьютера настраивайте. Но возможность конечно есть - микротик умеет работать с текстовыми файлами.

есть ли возможность настройки прозрачного proxy сервера с использованием PAC скрипта на Mikrotik?

Да, там есть встроенный прокси, нужные настройки можно скопировать из PAC скрипта.

Да в общем то - зачем вам панель?
Что такого она вам дает, из того что вы не можете сделать вручную?

Как увидеть сервер 1с который находится за NAT?

Никак. SMB через NAT не работает.
Если сервер за NAT доступа к нему можно организовать пробросив порты с роутера который делает NAT.
Как правило это порты 1541, 1560-1591, так же не забыть разрешить входящий трафик по этим портам в брандмауэрах и файерволах.

Это у вас надо спросить - нужны вам они или нет.
Если нужны - ставите, если нет не ставите.
На чистоту и легкость это никак не повлияет.

На windows нет штатных инструментов позволяющих настраивать приоретизацию трафика.
Разве что сторонний софт ставить, вроде прокси.

Интернет pppoe, входящая скорость ~600kb/s, исходящая ~60kb/s.

Что-то совсем плохо для ADSL.

Никак.
Только экспериментально.
А когда у вас там такой зоопарк это уже непредсказуемо, и даже экспериментально не определить.

Пользователь в браузере откроет 50страниц и на каждой будут JS скрипты, которые в сотню потоков будут чего-нибудь считать на вашем процессоре.

К тому же все сильно зависит от настроек.

Можно довольно точно подсчитать для одного приложения - например у меня есть приложение, я знаю сколько оно потребляет - дальше простая математика.
А ничего кроме этого приложения запустить невозможно, ибо прав нет.

Таким бардаком как у вас сложно управлять.
Но в любом случае начинать надо с логов.

В данный момент используется Dell R720 CPU 2xE5-2640 RAM 127 GB HDD 8xSAS 10K RAID6, и его уже не хватает.

Чего конкретно не хватает? Загрузка процессора? Очередь диска? Память?

Навскидку можно сказать что основная проблема в

HDD 8xSAS 10K RAID6

скорее всего именно это узкое место, хотя может быть и процессор.
По процессору у вас получается в среднем менее 0,2ядра на пользователя, запустить на этом такой зоопарк довольно проблематично.

Как увидеть звуковые карты через rdp?

Никак.
Система сама транслирует звук на удаленный стол, через специальную звуковую карту "удаленное аудио" доступ к реальной карте блокируется.
Это сделано для удобства.

При поиске по запросу сертификат cmd яндекс второй строкой выдает-
https://docs.microsoft.com/ru-ru/dotnet/framework/...

Получается, будут тяжбы с гражданином другой страны. Возможно ли это вообще?

Возможно.
Но надо понимать несколько вещей -
1)Разбирателства будут идти по законам той страны где проживает нарушитель.
2)Это очень не дешево. Представьте сколько вам обойдется найм юриста в конкретной стране, найм переводчика для общения с этим юристом?

Драйвер поставить - если поддерживается но не работает, дело явно в драйверах.

Хотя если это у вас системный диск - зачем оно надо, и так пойдет, тем более что диск SSD.

Такое даже на Windows сделать трудно, а уж на Ubuntu...
Просто примонтируйте раздел как папку и используйте.

Без разницы.
Чисто на уровне предпочтений - какой цвет больше гармонировать с системным блоком, тот и берите.