Ну так ты измени последний ключ на 99 и поменяй значение аи на 100
UPDATE FROM <имя таблицы> SET id=99 where id=4294967295
ALTER TABLE <имя таблицы> AUTO_INCREMENT=100
Поможет дамп только структур обоих баз (без данных) и сравнение их любой утилитой сравнения текстовых файлов.
Дамп структуры делается так: mysqldump -d -u root -p databasename > databasename.sql
