1. Используйте Debian, он бесплатен. Я бы не советовал связываться с российскими ОС, тем более для бизнеса они платные вроде как. И подороже винды))
отечественных ОС у нас нет, есть просто сертифицированная и частично проверенная))
2. Пробуйте для начала так же, возможно программа умеет в несколько потоков
3. Ну если есть рейд контроллер - тетсируйте как обычно, только с поправкой на количество дисков(например в плане скорости доступа)
если нет контроллера - просто исключите этот пункт из тестирования
По оперативки - там же слоты привязанны к конкретному процессору, надо смотреть что в инструкции по сборке указано, какие слоты могут работать по отдельности