Конфиг i3status/i3blocks и конфиг самого i3wm - это разные файлы.
System-wide это в /etc/i3blocks.conf и /etc/i3status.conf
Если юзать i3blocks, то там секция
# Temperature
# Support multiple chips, though lm-sensors.
# The script may be called with -w and -c switches to specify thresholds,
# see the script for details.
[temperature]
label=TEMP
interval=10
Как вы понимаете, нужно устновить lm-sensors и запустить один раз для настройки.
За i3status сюда:
https://i3wm.org/i3status/manpage.html#_cpu_temperature 
