echo("<!-- empty line -->");flush();
ps axf
- увидите в том числе процессы nginx, которые и обслуживают HTTP запросы. А происходит так скорее всего из-за режима GRACEFUL, когда каждый потомок продолжает обслуживать запросы пока они есть. Подождите минут 5-10, все потомки умрут - вот тогда трафик и остановится. Ну или можно сделать killall nginx
telnet 192.168.1.40 6024
запускать пробовали, что команда выводит на экран? А на сервере? Службу VipNet отключать пробовали? Ах, да, и с какой именно ошибкой не получается доступ к сайту?