Если данные не нужны, то в установщике винды на этапе, где большая кнопка "Установить", нажмите ниже "Восстановление системы", там запустите консоль и выполните diskpart.
В нём - следующие команды:
list disk (чтобы увидеть весь список дисков)
select disk N (где N - номер вашего диска)
clean (можно clean all, но это будет долго)
После этого диск будет виден, как чистый, если снова не будет виден - то у вас, видимо, какой-нибудь нестандартный контроллер, на который у установщика винды по дефолту нет драйверов. Впрочем, в таком случае diskpart его тоже вероятнее всего не обнаружит.