Супрессор включают параллельно входу, а не последовательно.
Если это иголки, не превышающие мощность супрессора, то ничего ему не будет.
Можно поставить более мощные супрессоры (2-3 шт.) или сборку.
Перед ними со стороны питания влепить предохранитель.
Как на рис. А, В только без резисторов. Слева вход, справа выход.
Можно и на резисторе несколько Вольт потерять, только мощность учитывайте.
От коротких выбросов можно еще LC фильтр посмотреть.
Если это просто повышенное напряжение питания, то проще найти преобразователь на большее входное напряжение.
Можно что-то на подобие LT4356 сделать, но, думаю, не в Вашем случае.