Хранение пароля к MYSQL в хэшированном виде?
Это невозможно.
Хэш пароля не содержит пароля - поэтому если вы пароль хэшировали, у вас будет только хэш.
Если вы храните только хэш пароля значит вы вообще не храните пароль.
Т.е хранить пароль в хэшированном виде значит вообще его не хранить.
Некая система написанная на php. Параметры подключения к БД (логин\пароль) хранятся в файле конфигурации в открытом виде.
Никак. Пароль в любом случае вам нужен будет для подключения.
Если не будет пароля значит вы не сможете подключится. Если вы его зашифруете - вам придется хранить там же ключ шифрования.
Единственный вариант - при каждом подключении вводить пароль вручную.