это не вирусы, а повреждение файловой системы, если диск подключался к какому-то экзотическому устройству - то оно вам скорее всего фс и повредило. Ещё такое может произойти при отключении жесткого диска когда на него велась запись и его провод был просто отсоединён без безопасного извлечения устройства.
НЕ проверяйте диск проверкой диска - это может безвозвратно повредить оставшиеся данные.
Сначала сделайте полный посекторный образ диска на какой-то другой диск (его объём будет размером с весь жесткий диск), только после этого экспериментируйте.
Из бесплатного dmde - советую обратиться на forum.ixbt.com за помощью, у вас спросят скриншот программы с найденными фс. (не делайте ничего в dmde без исправного посекторного образа)