Одна из причин нагрузки на процесс System, является работа с дисками. Вполне логично, что нагрузка упала после замены жосткого диска, вероятно, вы сменили диск на более производительный или меньшей степенью извноса. Система новая, не исключено, что имеющиеся драйвера, для вашего устройства работают не оптимально под этой ОС, к тому же Win8, на сколько мне известно, имеет статус Beta, в ней определённые механизмы могут работать не оптимально или с ошибками. Так что всё логично.