>> 1. Если торговая марка зарегистрирована позже домена, его могут забрать?
Это зависит от законов в той юрисдикции, в которой находится администратор доменной зоны, а также от массы обстоятельств дела. Причиной аннулирования регистрации домена может быть нарушение товарного знака (trademark) или права на фирменное наименование (company name) или права на коммерческое обозначение (business name) или недобросовестная конкуренция (unfair competition). Решение по домену может принимать административный орган (как, например, в КНР) и суд (во всех странах). В некоторых странах предусмотрены еще и арбитражные процедуры. Для определенности есть смысл проконсультироваться у юристов в соответствующих странах. По российским и международным доменам можно спросить у Антона Серго.
>> 2. Я так понимаю ТМ регистрируется в каждой стране отдельно. В какой стране должна быть зарегистрирована ТМ для международных доменов(.com, .org, .fm, .pro и т.д.)?
Лучше всего запросить администратора доменной зоны, в какой он находится юрисдикции.