Вопрос задан слишком обще.
Как я его понял — поставьте MediaWiki с SSL. Но, вероятно, этот совет вам не подходит, иначе вы и сами бы это сделали.
Так что уточните.
И, да — я понятия не имею, что такое «Juniper'овский портал». Описание в пару предложений сильно расширит круг потенциальных советчиков.
1) наличие ssl
2) списки доступа по ip или по паролю 3) персональный сертификат
3) индивидуальный логин-пароль
4) разграничение доступа
5) закрытие доступа к ssh, ftp и mysql
6) отсутствие посторонних сайтов на сервере, чтоб нельзя было слить контент, через другой сайт
но! если кто-то из авторизованных решит слить контент, эти меры мало помогут.