"Новые" офисные форматы (.docx, .xlsx, ...) - это по факту zip-архивы.
Новый (пустой) документ Excel распакуется в виде, ЕМНИП, шести папок и примерно десятка файлов.
Соответственно, их целостность можно проверить с помощью 7-Zip.
Но с .pdf такой фокус не пройдёт.
Текстовые файлы можно проверить с помощью анализа энтропии. Но тут вам потребуется понимание этого дела и, с определённой вероятностью, базовое умение программировать.
Анализаторы энтропии встроены в некоторые инструменты для data recovery, но они работают немного по-другому и с накопителями в целом.
Утилиты для отдельных файлов я сходу не назову, хотя почти уверен, что она должна существовать. Поищите в составе инструментов для forensic в духе Kali Linux и подобного.
Также посмотрите что используют те, кто анализируют прошивки, дампы чипов, и занимаются подобным реверс-инжинирингом.
Когда мне несколько лет назад потребовалась схожая программа, отображающая энтропию, я подходящего ничего не нашёл, в итоге писал не самый прямой костыль сам.