По-моему у вас Опера всё съела. Если сложить память всех её процессов. наверняка получится около озвученных 6 ГБ (не проверял). Попробуйте позакрывать половину вкладок и посмотреть что будет.
Вряд ли такое возможно на GitHub в пределах одного репозитория, т.к. изначально он создавался для коллаборации и open-source. Возможно вам имеет смысл сделать приватную копию репозитория для каждого ученика.
