Средств статистического анализа толковых для PHP просто нет. Да и теоретически не во всех случаях это возможно.
Для похожей задачи на PHP3 г;%:?*коде я сделал следующую поделку:
Используя
Tokenizer Залил 2 таблички:
functions: id, className, funcName, fileDef, lineDef
ussage: functionsID, calledFunctionsId
inherit: parentClassName, chieldClassName
После этого с помощью простых SQL мне стало легко искать где и что вызывается.
Поделка решала свою узкую задачу, по этому код её не публиковал. Кому интересно — может сделать толковую.