Точно не уверен насчет миэмовской, но в моем вузе учиться в магистратуре значительно проще по сравнению с бакалавриатом — предметов меньше, семинаров практически нет (только философия), половина экзаменов сдается автоматом.
Вот написать диссертацию может быть несколько сложнее, чем диплом, но если найти хорошего научного руководителя, то и тут проблем нет. Я, например, писал ее по своей основной работе — она как раз была связана с экспертными системами и диагностикой рака, так что в совмещении приятного с полезным нет ничего невозможного.
Опять же, по рассказам знакомых, магистратуры ВШЭ, РЭШ и т.п. это хороший способ завести много полезных знакомств.
P.S.: я закончил в этом году магистратуру мехмата НГУ (прикладная математика и информатика)