1) Фреймворк, как правило, рекомендует (а некоторые и навязывают) определенную организацию структуры кода, да. За это он тебе тоже кое-что дает - берет на себя типовую работу, что повторяется из проекта в проект, зачем ее делать каждый раз заново.
Да, функционал их разный. От минималистичного до всеобъемлющего.
Вполне можно использовать на одном сайте фрейморк CSS для верстки, фреймворк JS для динамики, фреймворк для бекенда. Если фреймворк для CSS и фреймворк для JS еще, возможно, и могут мешать друг другу (но как правило не мешают), то фреймворк для бэкенда функционирует на сервере как вообще независимая от CSS/JS вещь (CSS/JS фунционируют в браузере, а не на сервере).
2) Да. Если они специализированы на разных проблемах (Zurb Foundation для CSS и Vue.js для JS и Yii для PHP, например).
Но если они занимаются сходными вещами (например, React и Vue) то целесообразность такого применения непонятна. Более того - они запросто могут мешать друг другу. Нужно смотреть по ситуации.
3) Библиотеки - весьма конкретно-местный инструмент. Потому более независимы от проекта.
Фреймворки же нацелены на большую автоматизацию решения ваших проблем в какой-то конкретной ситуации, а вас от них более зависимыми (что не плохо, учитывая приносимую фреймворками пользу, просто нужно учитывать).
То что фреймворки используют библиотеки - не позволяет нам делать никаких дополнительных выводов.
Все используют библиотеки, это норма.
4) Штатные API выбранного сервиса карт (Yandex Maps, 2GIS Maps, OpenStreet Maps и пр.). Эти API реализованы в виде библиотек. Фреймворки тут вообще не при делах.
P.S.:
2GIS специализированный сервис:
В 2GIS очень хорошо представлены предприятия\фирмы\организации (в городах, где 2GIS присутствует), лучше прочих. Между городами 2GIS нет в принципе.