При помощи Imagemagick можно, например: https://imagemagick.org/Usage/text/

В MySQL 8+ добавили ALGORITHM=INSTANT к синтаксису:

ALTER TABLE table_name [alter_specification], ALGORITHM=INSTANT;

The benefit of the INSTANT algorithm is that only metadata changes are made in the data dictionary. There is no need to acquire metadata lock during SE changes and we don’t touch the data of the table.

https://mysqlserverteam.com/mysql-8-0-innodb-now-s...

‏Не перезагружаясь, первое что сделать, чтобы не записать что-нибудь поверх данных (как пользователь root):
mount -no remount,ro /dev/sdaX && swapoff -a
где X - номер раздела

СРАЗУ же записать копию журнала ФС на внешний накопитель:

debugfs -R "dump <8> /mnt/EXTERNAL_MEDIA/journal.copy" /dev/sdaX

Затем желательно снять точную копию раздела на внешний накопитель:

dd if=/dev/sdaX of=/mnt/EXTERNAL_MEDIA/partition.image

Восстанавливать можно в таком порядке:
ext4magic
Инструкция по случаям, что когда делать: Typical usage scenarios of ext4magic
Эта программа читает данные на более высоком уровне чем другие и способна восстанавливать файлы и директории с их правами доступа. ext4magic - переписанный с нуля вариант программы ext3undelete, более гибкий.
Если будет облом, то можно пробовать более низкоуровневые программы, способные восстанавливать на уровне сигнатур файлов (геморрой):
scalpel, foremost, testdisk, photorec.
Есть ещё платная R-Studio.