1) Как лучше ответить на это письмо?
Если на счете денег нет, то никак не отвечать и просто бросить аккаунт.
2) Могут ли PayPal подать сведения в налоговую (могут ли проверить факт того, что я платил налоги за все года)?
Если Вы отправите им свой ИНН, то все данные будут сразу в налоговой РФ и у Вас будут соответственно проблемы.
3) Могу ли я сейчас безпроблемно перейти на ИП и платить налоги с текущего момента?
Откройте ИП, валютный счет и работайте через банк без проблем. Даже если кто Вам платит будет ставить при оплате банковскую комиссию за счет получателя, то это будет меньше 320.
4) Если я вообще никак не буду отвечать на это письмо и уйду от PayPal, могут ли быть какие-либо проблемы?
Если у них Ваших данных нет (паспорт и ИНН), то никаких проблем не будет, каким образом они Вас достанут? Да и если поток денег через них прекратится, то и все вопросы отпадут.
Сейчас ситуация такова, что скоро вычислят практически всех, поэтому лучше открыть ИП и платить налоги, пока эти налоги и не такие большие для ИП.