Иван Смирнов, не поверите, но для того, чтобы у людей было место, где они смогут найти ответы на специфические вопросы, решение которых находится больше, чем в двух запросах к гуглу от них.
bl, важно, что у пакетов есть механизм удаления всех этих файлов, где бы он не располагались. Ваш вопрос относится скорее к ручной установке, из-за которой как раз и получает зоопарк, при котором всё лежит непонятно где.
Дмитрий, шлюз к проксированию отношения не имеет, на минуточку. Вот приехал пакет из вашего браузера на прокси. Что прокси дальше делает? Смотрит в таблицу маршрутизации и отправляет пакеты дальше в интернет. Через какой интерфейс и с каким адресом - зависит от таблицы маршрутизации.
Дмитрий, стало понятнее концептуально, но с точки зрения сетевого взаимодействия - не очень. Какое бы ПО у вас не стояло, рано или поздно нужно будет отправить пакет наружу, а это делается в соответствии с таблицей маршрутизации, которая ничего не знает про приложения.