Собственно, если файловый кеш даёт большую нагрузку на запись, то он делает это только на время его прогрева. Если нагрузка не падает, кеш просто не работает - обновляется слишком часто, и толка в нём в таком случае мало.
Если вы используете кеш APC, то он очень чувствителен к фрагментации, кстати. И не на много быстрее чем memcached. А при долгой работе, и высокой фрагментации, так вообще уступает ему и по скорости и по эффективному объёму, при прочих равных.