query_cache_type = 1
там myisam что ли? если да, и если таблицы большие, то надо менять на иннодб. кэш этот вырубать, тормозов от него больше чем пользы, особенно когда много записи идет. потом в зависимости от размера оперативки подобрать значения иннодбшных параметров
меня вот эта статья спасла
https://ruhighload.com/%D0%9E%D0%BF%D1%82%D0%B8%D0...
для 8 гб выглядит так
innodb_buffer_pool_size = 4G
innodb_log_file_size = 512M
innodb_buffer_pool_instances = 4
innodb_flush_log_at_trx_commit я поставил 0, так быстрее всего но типа ненадежно, но незнаю где там эта грань надежности и как надо базу нагрузить чтоб проломить эту грань, никаких проблем с данными больше чем за год не случилось.
https://ruhighload.com/innodb_flush_log_at_trx_com...
думаю что всё очень индивидуально, зависит от кол-ва столбцов и их типов, но от маисама лучше уходить. он начинает конкретно тормозить на таблицах от каких-нить 100к записей. перед уходом желательно убедиться не используются ли в нем какие то фичи которые еще не появились в иннодб. начиная с 5.7 вроде ничего такого не осталось. до неё были различия в работе с переменными
майсклтюнер дал не самые лучшие советы кстати, но близкие