Вы считаете среднеквадратическое отклонение, т.е. предполагается, что все ваши числа приближенно равны и в принципе не имеет значения сколько вы возьмете чисел из файла 10, 100, 1000 или
1 000 000. Количество значений выборки влияет исключительно на точность результата, само собой разумеется идеальную точность ни кто не требует, по этому выберите несколько случайный значений и не парьтесь