Где взять ActivePerl с модулями DBD::mysql и Geo::IP::PurePerl?

Попробуйте не ActivePerl, а https://strawberryperl.com/
Даже если нужных модулей не будет в комплекте, можно будет установить или собрать их традиционным способом через CPAN.

Как настроить MikroTik в одну подсеть на нескольких подразделениях?

Ну считайте, что я вас предупредил. Территориально распределенный кластер я бы стал строить только при наличии "тёмного волокна" или VPN с гарантированными характеристиками между локациями, иначе стопроцентно возникнут проблемы со стабильностью. Лучше было бы разместить кластер в одном месте, а скажем Proxmox Backup Server - в другом.
Кстати у вас есть общее хранилище SAN/NAS, которое используют серверы, или какая-то заменяющая его технология, например CEPH? Как виртуалка с упавшего сервера сможет запуститься на соседнем сервере, если её виртуальные диски будут на нем недоступны?

Как на Miktotik пустить трафик для определенного сайта через Wireguard?

Как вариант:
- Закинуть все домены сайта в address list, где они отрезолвятся в айпишники
- в ip -> firewall -> mangle сделать mark routing по исходящему транзитному трафику на этот address-list (в цепочке prerouting)
- в Routing -> Rules создать правило, которое перекинет трафик с нужным routing mark в таблицу маршрутизации, где дефотный шлюз за интерфейсом Wireguard

Почему коммутатор периодически перестает отвечать?

Думаю, тут надо проверять
- STP/RSTP (эти протоколы призваны устранять избыточные линки в сети, но могут и создавать проблемы, и их надо фильтровать на клиентских портах)
- loopback detection (если такой функционал есть в явном виде)
- конфликты mac- и ip-адресов
- возможную проблему с коллизиями мак-адресов, которой подвержены недорогие коммутаторы (https://habr.com/ru/articles/155265/)
В логах коммутаторов что-то есть в момент возникновения проблем?

Ну и на сети такого размера очень желательно вынести управление коммутаторами в отдельный влан.

Как настроить MikroTik в одну подсеть на нескольких подразделениях?

Тут нужно учитывать, что если кластер Proxmox - это действительно кластер, а не три одиночных сервера, то у него есть достаточно строгие требования к задержкам и потерям пакетов на кластерной сети. Очень может быть, что на туннелях через публичные сети кластер начнет постоянно разваливаться. И это не теоретическая проблема, мне потребовалось устанавливать на пяти серверах моего кластера отдельные сетевухи под кластерную сеть, несмотря на то, что между серверами изначально была сеть 10 Гбит/с. Но во время ночных бэкапов сервера периодически уходили в ребут, а после выделения отдельного сегмента под кластер все стабилизировалось.
https://pve.proxmox.com/wiki/Cluster_Manager#_clus...

Как восстановить диски с vm в Proxmox?

Если виртуалок много, то быстрее будет их восстанавливать из бэкапов, чем так. А вот команда "qm rescan" вместо "qm importdisk" позволяет радикально ускорить процесс. Но да, нужно быть аккуратным, чтобы не повредить данные.

Как получить ВСЕ ip адреса сайта(YouTube) и положить их в bat файл?

AuthorOfTheQuestion, для автоматического построения списка команд я использовал такую команду Linux (правда тут на выходе команды Mikrotik, но ничего не мешает изменить её под желаемый синтаксис). Да и сделать такое можно многими способами, подойдет даже Эксель.

wget https://www.gstatic.com/ipranges/goog.json -qO- | jq '.prefixes[].ipv4Prefix' | grep -v null | awk '{print "ip route add gateway=l2tp-vpn1 comment=auto-google-subnets dst-address="$0}' -

Как восстановить диски с vm в Proxmox?

Просто вернуть диски недостаточно. Надо еще добавить их в Proxmox как хранилища, причем сделать это так, чтобы данные не потерялись. А чтобы сказать точнее, слишком мало инфы: Proxmox поддерживает много разных технологий хранилищ и нужно понимать, как все было настроено до сбоя.

Как получить ВСЕ ip адреса сайта(YouTube) и положить их в bat файл?

Если вопрос конкретно про Google / Youtube, то все используемые гуглом подсети можно узнать из официального ресурса - https://www.gstatic.com/ipranges/goog.json
Список достаточно компактный.

Как восстановить диски с vm в Proxmox?

Посмотрите ProxMox,как добавить существующий диск сохранив содержимое?
Один в один та же проблема.

Как исправить в ProxMox "ошибка входа попробуйте еще раз" и "Login Incorrect"?

Странная проблема. Если ничего другого не помогает, то при наличии физического доступа к серверу можно сменить пароль суперпользователя. Для этого перезагружаетесь, в момент появления меню загрузчика Grub редактируете параметры загрузки, для чего нужно:
- выбрать нужный пункт загрузки (обычно можно оставить умолчательный)
- нажать E
- в конец строки параметров ядра добавить директиву, которая укажет ядру linux после загрузки запустить /bin/bash вместо /sbin/init (systemd)
init=/bin/bash
а опции "ro" и "quiet" стереть
Нужная строка выглядит примерно так:

linux   /boot/vmlinuz-5.19.17-2-pve root=UUID=5be71d13-4259-460d-85d5-da98b593931d ro  quiet

- нажать F10 для загрузки с измененными параметрами
- после загрузки сменить пароль root с помощью команды passwd
- перезагрузиться еще раз, желательно предварительно отмонтировав вручную корневую файловую систему (или перемонтировав её в read-only)

Как исправить в ProxMox "ошибка входа попробуйте еще раз" и "Login Incorrect"?

Пароль пользователя root при этом не менялся?

ProxMox,как добавить существующий диск сохранив содержимое?

RagePlusPlus, не совсем уверен, но возможно Диск 2 (1Мб) - это не диск для Windows, а служебный образ Proxmox типа TPM State или EFI Disk, который хранит настройки соответствующих эмулируемых устройств, и его нужно не отдавать виртуалке как диск, а подключать напрямую через редактирование конфига. И если он будет подключен правильно, то Windows сможет прочитать зашифрованные разделы, если они были созданы. Но тут у меня практического опыта нет, лучше спросите отдельным вопросом, кто-нибудь подскажет более предметно.

ProxMox,как добавить существующий диск сохранив содержимое?

Имеется ввиду примонтированные RAID-массивы на самом Proxmox? Если это файловая система, то нужно добавить точку монтирования в /etc/fstab, чтобы она автоматически подключалась при загрузке. Для LVM вроде вообще ничего не нужно, все должно определяться и подключаться при загрузке само.

ProxMox,как добавить существующий диск сохранив содержимое?

RagePlusPlus, для загрузки Windows как правило нужно, чтобы параметры загрузочного диска были как при её установке - тип загрузки CSM/UEFI, тип дискового контроллера и номер диска. Если подобрать комбинацию, при которой Windows загружается, не получается, то тут придется руководствоваться общими советами по исправлению проблем с загрузкой, или можно попробовать загрузиться с какого-нибудь iso-образа со средством решения таких проблем.

"innacebile boot device" - чаще всего это значит, что Windows на этапе загрузки не находит нужный драйвер для дискового накопителя, или сам диск поменял логическое расположение. Попробуйте переподключить его как SATA или даже IDE.

ProxMox,как добавить существующий диск сохранив содержимое?

RagePlusPlus, проверьте, чтобы тип SCSI-контроллера и номер виртуального диска совпадали с тем, что было до сбоя.

Какое есть сервисное решение для уведомления пользователей в закрытой Интранет сети?

В Kaspersky Security Center есть некий API, с помощью которого вероятно можно создать и запустить задачу на оповещение группы компьютеров.
https://support.kaspersky.com/help/KSC/14.2/KSCAPI...
Но подробно я не смотрел...

БИОС дает ошибку видеокарты, ПК не запускается. В чем проблема?

Легко гуглится, что на RX570 вентиляторы в простое могут не крутится. Кстати, компьютер именно не стартует или просто сообщает об ошибке видеокарты? Если индикатор HDD отображает какую-то активность, то можно попробовать дождаться загрузки операционной системы. В случае проблем со слетевшими настройками BIOS картинка появится после загрузки WIndows.

Почему при обращении к xml файлу отдает пустой документ?

Выгрузка отдается очень не быстро (на что намекает и ошибка, возвращаемая file_get_contents). попробуйте таймаут ожидания ответа сервера увеличить явно. https://stackoverflow.com/questions/10236166/does-...

Какое есть сервисное решение для уведомления пользователей в закрытой Интранет сети?

В корпоративных антивирусах с централизованным управлением такой функционал, как правило, есть (было и в ESET Protect, и в Kaspersky Security Center)