Я использую так:
1) ReadLater-сервис. Скидываю в Evernote клиппером всё, что хочу прочитать, и всё, что прочитал и заинтересовало.
Функционал, который привлекает:
 — оффлайн и онлайн-доступ к базе сохраненных страниц;
 — доступ с мобильника;
 — возможность выделить только необходимую часть страницы и в то же время сохранить форматирование.
 — возможность редактирования заметки;
 — возможность быстро перейти к исходной странице (к источнику)
 — мобильная версия evernote'a «поддаётся» readability-расширениям браузера.
2) Необходимые заметки из серии «запомнить на будущее».
Функционал:
 — прежде всего, качественный поиск, в том числе по скриншотам.
 — возможность разбить на блокноты, объединять блокноты в наборы по темам; задание тегов для заметок.
3) Планирование (быстрые заметки «что сделать»).
4) Как и в предыдущих ответах, «сиюминутные заметки», «запомнить быстро и ненадолго».
Если обобщить, то удобно скидывать в Evernote всё, что заинтересовало, хочется прочитать позже, хочется запомнить и т.д. Привлекает хорошим поиском, возможностью мобильного и оффлайн-доступа, возможностью быстрого создания заметки из части веб-страницы (клиппер) и из части экрана (скриншотом).