Варианты на вскидку какой-то должен сработать:
Итак у вас есть VPN значит проблем с внутренней сетью считаем нет.
---
Проблема либо в скорости канала, либо в RDP , либо в драйвере Easy Print.
Ну и еще могут быть экзотичкеские проблемы некоторые на клиентский комп ставят шлак с 1-2 гигами оперативной памяти - а этого даже для для RDP не достаточно, ну иногда еще работники торренты качают круглосуточно что тоже может убивать канал.
----
В остальных случаях порядок проверки вариантов таков:
1. Поставить на сервере драйвера,поставить приоритет драйверов, а только потом esyprint(в политиках AD это делается, в интернете есть куча инструкций).
2. Расшарить принтер на компе, подключить его на сервере как samba принтер. Поставить драйверы.
3. Поставить клиент 1С на комп с которого надо печатать, там скорее всего тонкого клиента будет достаточно.
4. Купить сетевушку для Атол(скорее всего продают ) и настроить на сервере доступ к нему.
5. Поставить на клиентский комп тонкий клиент с Linux, расшарить приинтер по LPR и подключить его на сервере - но это сложная заморочка скорее из первых 4 что-то подойдет.
6. А еще добавлю - если он компорт эмулирует - скорость компорта в настройках максимальную поставб может там стоит каких нить 9600 бод
Больше как бы вариантов не вижу.