Выявил проблему по
траблшутингу из официальной Вики.
У меня отсутcтвовал/был поврежден файл keytab. Я удалил тот что был.
Добавил в конфигурацию samba:
kerberos method = secrets and keytab
dedicated keytab file = /etc/krb5.keytab
После чего выполнил
net ads leave -u Administrator
net ads join -u Administrator
После чего появился файл keytab и SAMBA более не вываливается из домена, исправно обновляя ключи из keytab файла.
Если файл не появляется, рекомендовалось создать его вручную
net ads keytab create -U Administrator