Yustas Alexu

Когда сталкиваетесь с какой-то задачей в node.js с большой долей вероятности можно сказать, что эта задача уже решена кем то другим.
А по поводу import и прочего: вы не сможете засунуть их в переменную или передать в функцию в голом виде, можно только в виде строки.

Воспользуйтесь этим модулем app-module-path-node

Express.js это фреймворк, который не диктует как должно быть структурировано приложение. Поэтому вопросы про папки здесь бессмыслены. Шаблоны и другие файлы можно ложить куда угодно по своему усмотрению.

https://www.npmjs.com/package/fs-promise
https://www.npmjs.com/package/http-promise
При желании можно легко написать свою обертку под любой модуль.

Если есть список ссылок, то все очень просто, надо просто обойти эти ссылки. Если нужно по очереди, то просто после then вызываем ту же функцию рекурсивно или теоретически можно использовать async await вместе с циклом for (не forEach). Если порядок обхода не важен, можно опробовать Promise.all().
Еще есть полезная библиотека для работы с множественными асинхронными операциями async.

Windows Server R2 64-bit соответствует Windows 7 x64. Поэтому ни одна из версий вам скорее всего не подойдет.

Перед тем как изучать Express, не плохо было бы прочитать, что такое npm и зачем он нужен. Если вкрадце, без зависимостей ничего не будет работать.
Если подробнее: npm install устанавливает пакеты, указанные в package.json в директорию node_modules. Когда в приложении пишется:
var express = require('express');
нода ищет пакет express в папке node_modules и загружает его в приложение.

Попробуйте так:

var http = require('http'),
  fs = require('fs');

http.createServer(function(req, res) {
  if(req.url == "/") {
    fs.readFile("index.html", {encoding: 'utf8'}, function(err, content) {
      if(err) throw err;
      res.end(content);
    });
  } else if(req.url.includes('client')) {
    fs.readFile("client.js", {encoding: 'utf8'}, function(err, content) {
      if(err) throw err;
      res.end(content);
    });    
  } else {
    res.end("Bad request");
  }
}).listen(3000);

И убедитесь, что index.html в той же кодировке.

Используйте Node.js 6, там уже есть классы и стрелочные функции. Код станет намного компактнее и красивее.
По поводу служебных методов: если имеются в виду private-методы, то в этом нет особой необходимости. Но если все же очень надо, это делается через Symbol, WeakMap или замыкание. Примеры можно легко нагуглить. Так же есть вариант с декораторами https://github.com/elado/class-private-method-decorator
Но для него нужно подключать в проект Babel.
P.S. Если нужен чистый синтаксис можно использовать TypeScript. Пример из документации:

class Animal {
    private name: string;
    constructor(theName: string) { this.name = theName; }
}

new Animal("Cat").name; // Error: 'name' is private;