Vitsliputsli

array_slice ничего не удаляет, он дает срез массива, поэтому такая формулировка не очень корректна. Исходя из этого, вы не сможете удалить элементы внутри существующего массива, и единственный вариант - это создание нового массива с выбранными значениям.

$numbers = [
    '123',
    '124',
    '125',
    '111',
    '222',
    '566',
    '777',
];

$cleanNumbers = [];
foreach ($numbers as $key=>$number) {
    // не нужно делать универсальным поиск нужных значений, т.к. он слишком специфичен, поэтому так:
    if ($number[0]===$number[1] && $number[1]===$number[2]) {
        // здесь проще было бы написать $cleanNumbers[] = $number;
        $cleanNumbers[] = array_slice($numbers, $key, 1); 
        // а если нужно все таки удаление, то достаточно unset($numbers[$i]) с противоположным условием
    }
}
var_dump($cleanNumbers);

В итоге, на кой здесь array_slice - мне совершенно не понятно.

Вполне нормальная структура. Нагрузка низкая. СУБД та, которую лучше знаете (это актуально и для высоких нагрузок, тот же MySQL прекрасно себя показывает на высоких нагрузках, если вы его используете как базу данных, и не требуете приготовления кофе). Схемы здесь задействовать ни к чему. ClickHouse - это вообще про другое, забудьте до тех пор, пока не понадобится аналитика по большим объемам данных. Главное, не забудьте построить индексы по тем полям, по которым будете формировать выборки.

Используйте подготавливыемые запросы. Вы передаёте данные с кавычкой, это и вызывает ошибку.

Установите режим autocommit, и не парьтесь.
Когда изучите транзакции, тогда вернётесь к этому вопросу.

Абсолютно понимаю автора, он цитирует определение замыкания, а ему в ответ - определения не нужны, они лишь путают. Он спрашивает, а как тогда? Ему кто про мусорщик, кто про стек, и у него создается ощущение, что сами не могут договориться. Но кроме этого, автор прав, его функция - замыкание.
Замыкания везде работают одинаково. Если функция содержит ссылки на переменные объявленные вне тела этой функции, и которые не являются ее параметрами - это и есть замыкание. Что значит фраза - все функции в javascript - замыкания? Дело в том, что в других языках область видимости может просто не позволить обращаться к внешним переменным, в таких языках функция не будет замыканием, но может быть возможность превратить функцию в замыкание через специальный синтаксис. В javascript таких манипуляций не нужно, поэтому в нем любая функция - замыкание.
Т.е. замыкание это возможность в функции создать ссылки на внешние переменные. А здесь уже как следствие, работа мусорщика, если есть рабочая ссылка, то объект не уничтожается, а в приведенных примерах с 2 функциями она рабочая, так как можно получить доступ из корневого объекта, что удовлетворяет требованиям алгоритма mark-and-sweap. Но это следствие, а не принцип работы замыкания.
Поэтому автор абсолютно прав - его функция это замыкание. Потому что ни в одном определении замыкания нет никаких упоминаний о мусорщике, а значит разницы нет на какие внешние данные ссылаться.
Другое дело, все хотят видеть не замыкание, а его хитрое использование, а именно сохранение ссылки объявленной в замыкании при уничтожении ссылки во внешней функции. Не надо считать собеседующего бездарем, если бы вы ему объяснили свою точку зрения, он вполне мог бы и согласиться, хотя и не факт, многие собеседования проходят в виде допроса, что говорит о неадекватности или о слабой квалификации собеседующего, в такие конторы не стоит идти.

Вы получаете ошибку, потому как nginx не дождался ответа от php, который ожидает ответ от mysql, который лопатит ваш не хилый запрос на получение.
Разбивайте на части, управляйте этим в коде. Как уже указано, запускайте php не через nginx, а в cli. Записывайте не построчно, а тоже блоками. 150 000 это много, попробуйте блоки по 1000, а может и меньше.
Откуда взялся sleep? Если это троттлинг, то 30 секунд как то очень много.

Computer science - все таки это наука, т.е. более область академических исследований, а не computer programming. Вики на это намекает так "Computer science is generally considered an area of academic research and distinct from computer programming".
Дело не в том, что это какое-то знание, которое нужно или не нужно. Это иная сфера работы. Т.е. если ты формируешь и обучаешь модель для бизнеса с помощью CatBoost, ты занимаешься computer programming. А если ты пишешь сам CatBoost или вообще изобретаешь градиентный бустинг, то ты занимаешься computer science.