Ланской Кирилл, обычно ни на что не влияет, при прошивке только выставляется Old bootloader (у меня так), и внимательнее смотрим какой стоит чип, 168 или 328.
Ланской Кирилл, есть несколько уровней 'оригинальностей': оригинальный чип и сама плата, оригинальный чип и китайская плата, китайский чип и китайская плата. :-)
В npz обычно хранятся массивы. Список контуров таковым не является, хотя бы из-за того, что каждый контур может иметь разное число точек. Можно сохранить в npz растровую картинку с изображением контуров..
Мне кажется вы хотите странного и не до конца сами понимаете что вам надо и с какой целью.
Да, надо умножать на все матрицы. Или сначала вычислить произведение всех матриц, а затем координаты умножить на него. Внимание: произведение матриц некоммутативно, не перепутайте порядок умножения.
Контрольная сумма нужна чтобы проверить целостность, обнаружить ошибку. Если надо не только обнаружить, но и исправить ошибки, то для этого есть коды исправляющие ошибки. Хэмминга, Рида-Соломона и прочие БЧХ.