Запретите вход по паролю или используйте очень сложный пароль. Поставьте fail2ban/ Если паранойя еще не отпустила, то поменяйте номер порта.
Этого более, чем достаточно.
Поставьте панель управления. И сервер на Linux. Зачем страдать с ручной настройкой?
Либо можете посмотреть эти сценарии, для ручной настройки, может помогут.
Будет. В режиме CGI или FastCGI
Быстрее будет FastCGI. Немного с настройками пострадать придется.
Аpache надо будет изменить на Prefork. И настроить руками некоторые лимиты.
Только, как модуль Apache не запускайте сайты.
Для начала вам нужен нормальный хост или в качестве хоста виртуалка на том же Virtualbox.
Допустим с хостом разобрались. Если нужны нормальные контейнеры с полноценной ОС, то лучше OpenVZ еще ничего не придумали.
