Sanes

Я бы новый инсталл делал. Диверсифицировал риски.

Есть разные реализации модульности. Если вы про это.
Для небольшого приложения я не стал заморачиваться, а просто разнес по директориям контроллеры, вьюхи и т.д.

Только через VPN.
NAT не пропустит входищее соединение.

Купить еще один VDS и установить туда Billmanager.

Поставить один нормальный роутер в коридоре (3) и везде будет работать.
Проблема на ровном месте.

Да нет там никаких плюсов для бизнеса.

Снимите квартиру. Можно в пригороде, будет дешевле.

Обратитесь к специалисту. Это частный случай и вряд ли вы чего здесь для себя проясните.
Не забудьте проверить имя домена в базе, таблица wp_options

Устроится в профильную организацию и посмотреть изнутри, как это работает.
Или сделать свой продукт. По ходу дела решите текущие вопросы.
Сухая теория вам ничего не даст.

Запретить подключение всем IP, кроме сети VPN.

Насколько знаю, там LXC они переделывали и что-то в итоге у них не взлетело.
В Proxmox пользуюсь только KVM, а для контейнеров выбрал OpenVZ v7.
На худой конец лучше LXD использовать, да и то. Ну их, полно ограничений.

У средней региональной студии собственно основной доход именно с этих позиций.
Накидать простой сайт и заниматься продвижением.

Billmanager

Только менять местами условия.
99% владельцев магазинов с онлайн-оплатой не задумываются о механизме возврата средств.
Начните с этого.

Настроить почтовый сервер и DNS.
Если Яндекс, то он не любить повторяющиеся письма. По содержанию и отправителю.
https://www.mail-tester.com/

Какие основные шаги мне нужно предпринять для реализации этой задумки?

Обратиться к исполнителю с опытом реализации подобных проектов.

У хостеров коннекты до точек обмена траффиком.

Удалите Remi репозиторий. Панель ставится на чистый минимальный сервер.
А лучше ставьте на Debian 9. Это оптимальный вариант. На Centos установится протухшая версия MySQL 5.5

Это один адрес, а не сеть.