Можете использовать агрегатор платежей FreeKassa, но там высокая комиссия.
В плане Qiwi - используйте: https://qiwi.com/api - тут менее всего удобно, ибо нет уведомлений о новых платежах, но есть методы для проверки, так что также просто подключается.
В плане WebMoney - можно использовать WebMoney Merchant(https://merchant.webmoney.ru/conf/default.asp), там не надо ИП, он работает с начального аттестата - получить можно за 10 минут через банковский платеж.
В плане Яндекс.Деньги ответ выше дали, пользуюсь такими же методами.

UPD: Qiwi добавили webhook'и, теперь можно без шаманаства с CRON получать данные.

В плане всей ситуации:

Профильные("рабочие") проблемы
Преимущественно вопросы/проблемы у пользователей часто повторяются. Подготовьте шаблоны ответов на часто встречающиеся проблемы.
Важно чтобы он:
1. Был компактен, желательно оформлен как пошаговая инструкция.
2. При возможности - имел иллюстрации.

3. Свести к минимуму техническую терминологию, использовать понятный язык пользователю
4. Использование "Если ..., то ...". - добавляйте информацию об связанных проблемах, или других схожих исходах, чтобы уменьшить потенциальные будущие обращения.

Непрофильные проблемы

Желание сделать лучше квалифицированный отбор имеет смысла, но есть существенные проблемы:
1. Старые сотрудники останутся. Если нет текучки - подобное решение только в далекой перспективе поможет.
2. Если проблема не возникает на регулярной основе от преимущественного числа сотрудника - увеличение требований может нерационально сказаться на ЗП сотрудникам.

Не можете бороться с движением - возглавьте его: соберите частозадаваемые вопросы, как рекомендовал Владимир Куц поясните руководству на цифрах, что вы рискуете и занимаетесь рутинной ерундой.

Предложите сделать платные тренинги "неучам" после работы.
Обоснование: у Вас будет мотивация этим заняться и таким образом компания будет работать эффективнее. Иначе выходит что из-за одного человека фактически стоит работа, при этом:
* Крутится аренда
* Растут расходники
* Начисляется ЗП сотрудникам

Таким образом, Вы только сэкономите деньги компании, а сами заработаете.

"Invalidate Caches", "Repaire IDE" не помогли, даже усугубили - перестал ещё работать "Refactor => Rename".

Попробовал отключить плагин Yii2 Support - и всё заработало: и переименование, и поиск.
И что самое интересное - проблема началась 2 месяца назад, и примерно тогда я и установил плагин

P.S. Сейчас вновь включил плагин, и пока всё вновь нормально работает. Возможно, проблема связана с конфликтом процедуры индексации и плагином.

Зависит всё от тематики сервиса. Если это файлообменник - в первую очередь можно поработать над повторами файлов - хранить хэш файлов, к нему обращаться и не хранить повторы.

Также можно хранить данные в Яндекс.Диск, Dropbox и тому подобное.

Вводить лимитирование на скорость/объем.