Описание проблемы на примере Nekoray:
после запуска клиент Nekoray работает только в режиме системного прокси, после копки "stop" отключается, но перестает работать интернет в браузере и приложениях, хотя визуально основное интернет подключение работает. Все начинает грузится только после физического закрытия самой программы в трее снизу.
Вам мешает default gateway чтобы пинговать 1.1.1.1 на Вашей внутренней машине.