Не только можно но и нужно:
1. Собирается через Grunt/Gulp
2. Минифицируется
3. Сжимается gzip-ом
4. Кэшируется браузером
5. Использует только 1 реквест на сервер.
При загрузке сайта у разных браузеров есть ограниченное количество одновременно выполняемых запросов (на мобилах вообще мало), кроме того у вас там ведь не только JS файлы, есть еще css, картинки и т.п. Они все встают в очередь на загрузку. Так что, в 99,9% случаев, загрузка одного JS файла будет всегда быстрее чем загрузка нескольких.