Прорисовка курсора мыши в Windows выполняется из ядра. Никакой процесс в юзерспейс не может воздействовать на это. Даже, если запустить одновременно двадцать процессов, каждый из которых способен нагрузить CPU на 100%, то мышь все равно будет резво бегать по экрану и щелкать по не реагирующим ни на что окнам.
Такое атипичное торможение курсора возможно из-за:
- Проблемы с железом. Например с HDD (про то, что нужно смотреть SMART уже упомянули выше).
- Экстремальный перегрев CPU. Например, при снятии кулера на ходу по-горячему, камень от Intel не сгорит сразу, но система начнет работать рывками (1% в работе, 99% ожидание рассеивания тепла), выглядит это именно так - прыжки мыши, заикания звука. Совет: проверить температуру, проверить наличие термопасты (не высохла ли).
- Проблемы с драйверами. Теоретически любой модуль, загруженный в пространство ядра, может вызывать такое поведение, но практически, чтобы создать такой драйвер, нужно быть ну очень криворуким кодером и наплевать на все, что написано в DDK по поводу обработки прерываний и DPC. Исключение - драйвера к видеокартам, такое ощущение, что разработчики отдают их на аутсорс индусам, а документацию к железу передают им на китайском.