склоняюсь к адаптивной версии, возможно, я не прав, но в плане индексации должны быть плюсы, чем от использования основной+мобильной версий
в будущем вам проще будет поддерживать адаптивную версию сайта, изменять расширения, чем вносить синхронные изменения сразу в две версии сайта
Когда сам сталкивался со сложностями перехода к адаптивному варианту, казалось, что сайты сложны и малоадаптируемы, но постепенно как-то вырабатывалась схожая по действию адаптивная версия.
Сложности кажутся только от того, что, возможно, вы не занимались этим много и часто. Хотя не исключено, что чем-то и придется жертвовать.