raid не требует дефрагментации потому что в нем нет такой сущности, дефрагментацию требует файловая система, которая может быть размещена на raid массиве.
Запустите инструмент дефрагментации от майкрософта, он проанализирует и посоветует вам, нужна ли она или нет. Обычно, если свободное место на вашем диске никогда не уменьшалось меньше 30% (на самом деле зависит от характера использования, и может быть хватит и 10%) от общего объема, то файлы на диске не будут фрагментированы в принципе.
Фрагментация появляется, если во время записи (увеличения) файла, места на диске мало, и система начинает его распихивать по дыркам, оставшимся от удаленных ранее файлов.