Я думаю, что тебе вот
это должно помочь. Только сделай как тебе удобней в зависимости от твоей топологии сети.
Если нет, то объясни подробней, что значит "… он не позволяет очевидным образом выбрать место для сохранения торрента.". Если ты имеешь ввиду, что все торренты хранятся где-то в «C:\Documents and Settings\...», то выход такой: найди эту папку и перемести куда тебе нужно, а потом сделай
симлинк на неё.
На счёт пользователей не знаю. Но, в принципе, можно реализовать средствами ОС.