Можно. Windows переназначит этому диску новую букву, выбрав первую из свободных. Так же можно подключить диск не как букву а как каталог (правая кнопка на Мой компьютер, управление, управление дисками)
p.s. информация о букве диска хранится не на самом диске (там только идентификатор) а в операционной системе, в реестре.
Кстати из-за этого не получится просто скопировать os на второй диск D и потом вынув первый загрузиться с него, так как система будет помнить что это диск D и подключит его соответственно, и не загрузится. Приходится в реестр после копирования править.