Фишка простая - не трогай, что работает. Максимум публичные методы интерфейса программы.
Также есть специальные автоматические чистильщики кода, которые рефакторят его по стандартам, но могут сломать код.
Очень классная фишка - поиск и замена с регулярками. Также анализатор зависимостей и callstackов (прямого и обратного). В целом это называется IDE.
Очень крутая штука - делегировать задачу стажёру или в обратку программистам. Лучше всего просто игнорировать её. Никто не полезет читать код от скуки.
P. S.
1000 строк - это очень мало, чтобы тратить время на форум, поиск и установку инструментов.