Порты МК в режиме чтения находятся в высокоомном состоянии и приложение к ним напряжений лог. 1 совершенно безопасно.
Проблема будет если поставить порт на вывод, выставить низкий лог. уровень и подключить это дело к источнику, вот тогда будет КЗ на землю / ну или постаивть в режиме push-pull лог. единицу, а вывод посадить на землю.