Есть различные SAST (Static Application Security Testing) инструменты для статической проверки проекта. Есть SCA (Software Composition Analysis). Но SCA может найти только известные проблемы, если кто-то вчера выложил какой-то опер-сорс проект (кустарный, наверняка с уязвимостями) - SCA тут не поможет, а вот SAST - может. Зато SCA сразу скажет, что вы используете такую-то зависимость, а в ней есть уязвимости. (Часто функции SCA и SAST - в одном флаконе)
Естественно, это автоматические проверки. Сейчас, со всякими AI - они довольно неплохие (лучше, чем беглое чтение кода ленивым программистом), но далеки от абсолютного решения. Ну и общее правило минимизации доверия - хорошо бы, чтобы система была так спроектирована, чтобы даже уязвимые ее куски имели ограниченный "радиус поражения".
Но в целом, заведомо надежной защиты (особенно от хитро запрятанного бэкдора) нет (кроме архитектурной). К тому же, новые версии постоянно выходят. Вам либо придется каждый раз разбираться, зачем вышла новая версия, были ли уязвимости в старой и опасны ли они для вашей ситуации (а это долго и дорого), или просто сразу ставить новую (более правильный подход, но тоже рискованный). И даже если предыдущую версию изучили вдоль и поперек - новую-то нет и в ней может прийти сюрприз.