Конечно. Регистрируетесь, и на компе и мобилке авторизируетесь с одного email'а.
Этого должно хватить. При запуске, anki будет проверять данные на облаке и данные на текущем устройстве, если на облаке новее, то он автоматом будет их подгружать. Если закрыть программу, он выгружает данные на облако. Поэтому когда позанимаетесь, нажимайте на кнопку "Синхронизировать" или сами закрывайте программу.