MD — это Markdown, если я правильно понял? Я вижу два варианта.
1. Можно попробовать какую-нибудь систему автоматизированного перевода; например, memoQ. Они весьма хороши для больших текстов, особенно если в них много буквальных повторов; умеют считать прогресс, автоматически делить на абзацы или предложения, хранить старые версии перевода. Правда, если я ничего не пропустил, ими либо очень дорого пользоваться, либо надо ломать. Плюс, скорее всего, придётся переделывать вёрстку после перевода, хотя это дело 15 минут.
2. Вариант «дёшево и сердито» — Sublime Text 2 в режиме подсветки синтаксиса Markdown. Прекрасный текстовый редактор с кучей полезных приблуд.